Модель машинного обучения ProPublica для будущих вспышек Эболы — ProPublica

Aug 27, 2023

Следующая пандемия — это просто вырубка леса. Мы делаем недостаточно для предотвращения распространения вирусов от дикой природы к людям.

ProPublica — некоммерческая новостная служба, которая расследует злоупотребления властью. Подпишитесь, чтобы получать наши самые важные истории, как только они будут опубликованы.

Подпишитесь на рассылку Big Story.

Спасибо за регистрацию.Если вам нравятся наши истории, поделитесь ими с другом?

Чтобы узнать больше о том, как быть в курсе событий, обязательно ознакомьтесь с остальными нашими информационными бюллетенями.

Основанная на фактах, независимая журналистика необходима сейчас больше, чем когда-либо.

В этом году на ProPublica мы объединили компьютерное моделирование с традиционными репортажами, чтобы изучить вопросы, связанные с вирусными вспышками: что их вызывает и что можно сделать, чтобы предотвратить следующую большую вспышку?

Одной из самых страшных болезней является Эбола, которая убивает около половины людей, которых она заражает, и показала, что она может появиться в неожиданных странах, таких как Гвинея. Вирус перешел от дикого животного к человеку в 2013 году, что привело к эпидемии, в результате которой погибло 11 000 человек по всему миру.

Исследователи, изучающие начало вспышек, узнали, что вырубка лесов может увеличить вероятность перехода патогенов от дикой природы к человеку. Хесус Оливеро, профессор кафедры биологии животных Университета Малаги (Испания), обнаружил, что семь вспышек Эболы, включая ту, которая началась в Мелианду (Гвинея), были в значительной степени связаны с потерей лесов. Мы обнаружили, что примерно в пяти из этих мест вспышки леса были вырублены по характерной схеме, что увеличивает вероятность того, что люди смогут делить пространство с животными, которые могут быть переносчиками болезни.

Мы задавались вопросом: можем ли мы использовать то, что мы узнали об этих местах, чтобы найти места, где еще не было вспышек, но которые могут подвергаться риску ее возникновения? Были ли места, где могла появиться Эбола, очень похожие на Мелианду в 2013 году?

С помощью эпидемиологов и экспертов по потере лесов, а также одного из консультантов ProPublica по науке о данных, Хизер Линч, профессора экологии и эволюции в Университете Стоуни-Брук, мы разработали модель машинного обучения, предназначенную для обнаружения мест, поразительно похожих на другие места. которые пережили вспышки.

НИГЕРИЯ

ДЕМОКРАТИЧЕСКИЙ

РЕП. КОНГО

Атлантический океан

Все кандидаты в модели

Отмеченные кандидаты

Результат? Из случайной выборки из почти 1000 мест в 17 странах модель ProPublica выявила 51 область, которая в 2021 году (последний год, когда на момент нашего анализа были доступны данные спутниковых изображений о потере лесов) очень напоминала места, произошли вспышки, вызванные изменениями в лесах.

Эти места находились в лесных зонах Африки, где, как полагают, обитают дикие животные, являющиеся переносчиками Эболы; в которых недавно произошла обширная фрагментация лесов (то есть вырубка лесов на многих небольших, разобщенных участках); и у которых есть исходный уровень численности населения, который может выдержать вспышку, если она возникнет. К нашему удивлению, 27 из них находились в Нигерии, где вспышка Эболы никогда не начиналась.

Изучив наши выводы, один из исследователей, с которыми мы консультировались, Кристина Фауст, научный сотрудник Университета Глазго (Шотландия), назвала этот анализ «лучшей оценкой риска» в свете множества нерешенных вопросов о том, как возникает Эбола.

«Вы четко определили экологические особенности, которые одинаковы для всех мест распространения», — сказал Фауст. «И эти экологические условия и человеческие условия возникают и в других местах. И учитывая, что мы не так уж много знаем о резервуарах, я думаю, что это наша лучшая возможность провести анализ рисков».

Эта модель была разработана на основе более раннего анализа, который мы опубликовали в феврале. Мы использовали спутниковые снимки и эпидемиологическое моделирование, чтобы показать, что деревни, где произошли пять предыдущих вспышек Эболы, сегодня подвергаются большему риску распространения вируса, включая Мелианду, Гвинея, место самой страшной вспышки Эболы в истории.